學術界這樣認為，一是來源於中國古代原始宗教的崇拜物。即：自然崇拜、圖騰崇拜、鬼魂崇拜和祖先崇拜。
所謂“自然崇拜”，就jiu是shi在zai遠yuan古gu時shi代dai，人ren們men由you於yu自zi身shen力li量liang的de微wei薄bo和he生sheng產chan力li的de低di下xia的de緣yuan由you，開kai始shi將jiang不bu能neng占zhan用yong惡e劣lie環huan境jing的de希xi冀ji寄ji托tuo在zai原yuan本ben存cun在zai的de大da自zi然ran物wu上shang麵mian，比bi如ru：天、地、日、月、星辰、雷、電、風、雨、山川、河流等，這些都是他們的信仰對象，而且他們還將其神化來加以崇拜。於是，便產生了最早的神仙譜係的雛形：例如土地、星君、雷公、電母、風伯、雨師、山神、河神等。
後來，隨著人們生存環境和生存息息相關的種種的發展及進步，以及道家思想的逐步形成及提出、宣說，中國原始社會的自然崇拜開始向人為宗教（即神學宗教）過渡。據記載，大致在殷周時代，鬼神崇拜、方仙信仰開始在自然崇拜的基礎上產生。《周禮·大宗伯》中記：天神有昊天上帝、日月星辰、風師、雨師、地神有社稷、五嶽、山林川澤、四方百物，人鬼則祭祖先也。
中國古老宗教道教，就是在此基礎上逐步充實起來，並形成了一套日趨完善的神仙譜係，即天神、地神、人鬼的崇拜係統。所以說，自然崇拜為道教神靈崇拜的主要來源。
圖tu騰teng崇chong拜bai和he自zi然ran崇chong拜bai一yi樣yang，它ta的de形xing成cheng淵yuan源yuan依yi然ran來lai自zi於yu當dang時shi人ren們men生sheng存cun之zhi環huan境jing和he狀zhuang態tai的de種zhong種zhong。於yu是shi，古gu老lao的de人ren們men開kai始shi將jiang某mou種zhong動dong物wu或huo植zhi物wu作zuo為wei崇chong拜bai的de對dui象xiang。例li如ru，龍long、鳳、熊、玄鳥、花、槐等。並在此基礎上賦予這些動物或植物以人格化或神化，於是而產生了諸如龍神、花仙等之類的神靈。
另外，在一些部落族群中，還隨之產生了這樣至高的崇拜。譬如：鄂倫族將公熊稱為“雅亞”，意為祖父；將母熊稱為“太帖”，意為祖母。而鄂溫克族人則將公熊稱為“和克”（祖父）；將母熊稱為“惡我”（祖母）。如此等等，目的旨在表達是一種神靈的崇拜。
此外，在苗族、瑤族、佘族的中間，還流傳著盤瓠的傳說。
後來，道教將這些神靈繼承的基礎上組織、發展，最後形成了道教中具有一定人格象征的神仙。
zhiyuguihunchongbai，zeshiyuanshizongjiaoxinyangjiweipubiandexinyangxingshizhiyi，shiziranchongbaihetutengchongbaidejinyibufazhan，yeshiyuanshirenleishehuizishenjinyibubaituoziranjieshufudeyigezhongyao、具體體現。
鬼魂崇拜的產生，源自於原始人類和自然界作鬥爭的過程：zaiqijian，yuanshirenleizhujianjiaqiangleziwoyishi，tamenkaishimohudiyishidaozishendecunzaihezuoyong，jianjianmingbairenleiyaoxiangshengcunhefazhan，bujinyaoyilaidaziran，erqiehaixuyaoyilairenleizishen。zhishi，yuanshirenleifuzhuyuzhezhongrenshishiqueshiyidiandaodexingshichuxiande。tamenrenwei，jiranziranwuhedongzhiwuyoushenling，namerenzishenyeyinggaiyoushenling，yushiguihundeguannianbianchuxianle，suizhiyanshengchudeshiguihunchongbai。
原始人類開始賦予虛幻無常的鬼魂以影像，故而，我們見到了存在於道教神靈中的閻王、黑白無常、guiwangdengdeng。jushuo，cileiguihunweilizuzongjiaodeyizhongzhuyaoneirong，jienshitujiazurenyuanshizongjiaoxinyangzuizhongyaodeyibufen。ciwai，guihunchongbaihaichengweiyaochuandaojiaodeyigezhongyaozuchengbufen。
那祖先崇拜，便就是以祖先亡靈為崇拜對象的一種宗教形式。在遠古社會中，由圖騰崇拜過渡而來。其崇拜行為的特點：shouxianjiangbenzuzuxianshenhuabingduizhijibai，juyoubenzurentongxingheminzupaichixing。qicishixiangxinqizuxianshenlingjuyoushenqichaofandeweili，huibiyouhoudaizurenbingyuzhigoutonghugan。zuihoushichaoyueleyuanshitutengchongbaiheshengsichongbaiderenshijuxian，buzaiyongdongzhiwudengtutengxiangzhenghuoshengzhixiangzhenglaizuoweiqishizubuluodebiaozhi，eryiqishizuzuxiandemingzilaiqudai。
由此，古代宗教從自然崇拜上升到一個人文崇拜的高度。後世道教中繼承發揮了這一崇拜，於是產生了像黃帝、三皇五帝之類的神靈。
二是，對聖賢崇拜的承襲。例如孔子、孟子、關公、嶽飛等。
在早期道教經典《太平經》中，便就有了“聖人”、“賢人”的崇拜概念。而在《上清眾仙真記》、《真靈位業圖》、《無上秘要》中，則描述了堯、舜、禹三王，殷湯、周武、齊桓公、漢高祖、劉備等帝王，和諸子聖賢孔丘、顏回、墨翟等。
如此，這些聖賢在道教神仙體係中皆占據著極其重要的位置。
三是，教派因素對道教神仙譜係的構建也有重要影響。道教教派眾多，從創教之始，在至上最高神上就有所分歧。
早期的五鬥米道創教時，是以太上老君為教主，供奉“三官”。到魏晉南北朝時，北魏寇廉之的天師道，由於其享“天師”之位，受“清整道教”之命，得《雲中者音誦新科之誡》20卷，均假“太上老君”之名立教，故而，也依然崇奉太上老君為教主。
然而，這之後，道教中的上清派、靈ling寶bao派pai相xiang繼ji出chu現xian，他ta們men不bu再zai尊zun太tai上shang老lao君jun為wei上shang神shen，而er是shi各ge具ju其qi神shen靈ling。靈ling寶bao派pai以yi元yuan始shi天tian尊zun和he太tai上shang大da道dao君jun地di位wei最zui顯xian，上shang清qing派pai以yi元yuan始shi天tian王wang或huo太tai上shang玉yu晨chen道dao君jun為wei最zui尊zun。與yu此ci同tong時shi，一yi些xie經jing書shu也ye開kai始shi將jiang太tai上shang老lao君jun的de地di位wei排pai列lie稍shao次ci。
直到後來，在各派的協商、融合中提了“道不可無師尊，教不可無宗主，故老君師太上玉晨之弟子也”的共識，正是在這種師徒關係下，才形成了三位一體的“三清尊神”，並將其視為道教神仙譜係中的最高神。
另外，各派有又有自己的創派真人、主祭神靈等。
由以上種種我們可以看出：道教是在吸收種種原始宗教、民間宗教、神話傳說的基礎上，逐漸形成了自己紛繁複雜的神仙譜係。